این دانشکده به عنوان دومین دانشکده مستقل مهندسی پزشکی کشور در مجموعه وزارت عتف در سال 1396 و براساس مجوز هیات امنای محترم، آغاز بهکار نموده است. با این وجود اولین دوره از دانشجویان مهندسی پزشکی دانشگاه صنعتی سهند از سال 1376 و در قالب دانشجویان مهندسی برق با گرایش بیو الکتریک، در مقطع کارشناسی دوره تحصیل خود را آغاز نمودهاند. در حقیقت دانشگاه صنعتی سهند در ایجاد رشته مهندسی پزشکی از دانشگاههای پیشتاز در زیر مجموعه وزارت عتف محسوب میگردد. فارغالتحصیلان رشته مهندسی پزشکی دانشگاه صنعتی سهند از سال 1381 وارد بازار کار و فعالیت شدهاند و از همان سال تاکنون در مقاطع مختلف تحصیلی بالغ بر 850 نفر فارغ التحصیل داشته است. با توجه به قدمت دانشگاه صنعتی سهند در آموزش دانشجویان مهندسی پزشکی، فارغالتحصیلان این دانشگاه در عرصههای مختلف تحقیقاتی و صنایع وابسته به مهندسی پزشکی به نحوی قابل توجه موثر و فعالند. لازم به ذکر است، این دانشکده در حال حاضر در گرایشهای بیوالکتریک و بیومکانیک در کلیه مقاطع تحصیلی فعال است.